La educación superior comprende los niveles de Técnico Superior, la Licenciatura y el Posgrado.

Los estudios de Técnico Superior tienen una duración de dos o tres años, y se imparte en la Universidad Tecnológica de Tijuana.

La Licenciatura es de cuatro años de duración en promedio. Se imparte en carreras clasificadas en las siguientes áreas de estudio: Educación y Humanidades, Ciencias de la Salud, Ciencias Naturales y Exactas, Ciencias Sociales y Administrativas, así como en las carreras de Ingeniería y Tecnología y las que pertenecen al área de Ciencias Agropecuarias.

En los primeros dos niveles se capacita al educando para el ejercicio de una profesión.

El Posgrado es posterior a la licenciatura y se divide en especialidad, maestría y el doctorado, y su objetivo es la formación de profesionistas con una alta especialización en las diferentes áreas del conocimiento. Dichos servicios se imparten en instituciones de sostenimiento autónomo (Universidad Autónoma de Baja California), estatal, federal, federalizado y particular.